По сюжету, крокодил Гена находит Чебурашку в коробке из-под апельсинов, и тот помогает крокодилу завоевать популярность в зоопарке.
Это первый фильм о персонаже из книг Эдуарда Успенского, выполненный в технике 3D-анимации. В 2003 году компания SP International выкупила у «Союзмультфильма» права на распространение в Японии мультфильмов о приключениях Чебурашки до 2023 года. В 2010-м выходил рисованный сериал, а в 2013-м — полнометражный фильм.